Рецензируемый научный журнал «Вестник НГАУ» учрежден постановлением Ученого совета федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Новосибирский государственный аграрный университет» в 2005 г. В этом же году он зарегистрирован как средство массовой информации с территорией распространения г. Новосибирск и Новосибирская область (свидетельство о регистрации ПИ № ФС12-0633). В 2009 г. журнал перерегистрирован с территорией распространения Российская Федерация (свидетельство ПИ № ФС77-35145).
С 2009 г. журнал включен в систему Российского индекса научного цитирования (договор № 04-02/09б от 04.02.2009 г.). ISSN журнала 2072-6724. Подписной индекс распространителя по договору подписки – 94091 в объединенном каталоге «Пресса России».
С 2013 г. материалы, изданные в журнале, выборочно включаются в международную реферативную базу данных AGRIS.
С момента образования и по настоящее время главным редактором научного журнала «Вестник НГАУ» является доктор технических наук, профессор Александр Сергеевич Денисов – ректор ФГБОУ ВО Новосибирский ГАУ.
Заместителем главного редактора и научным редактором журнала является доктор ветеринарных наук, профессор Григорий Антонович Ноздрин.
В состав редколлегии входят ведущие российские и зарубежные ученые.
Состав редакционной коллегии представлен на первой странице журнала и включает 6 зарубежных ученых, 4 академика РАН, 14 докторов наук.
У научных статей, публикуемых в журнале имеется библиографический список, оформленный по ГОСТ Р 7.0.5–2008, ключевые слова и аннотации (на русском и английском языках).
За истекший период журнал приобрел признание широкой научной общественности. Особо следует отметить практическую направленность большинства публикуемых материалов.