Полиморфизм микросателлитных локусов ярославского скота в стадах различного селекционного значения

В работе представлены результаты изучения полиморфизма микросателлитных локусов крупного рогатого скота ярославской породы в племенных стадах Ярославской области. По 15 микросателлитным локусам ДНК было выявлено 115 аллелей с различной частотой встречаемости. В каждом из изучаемых локусов идентифицировано от 5 до 11 аллелей. Среднее число аллелей на локус составило 6,41, количество эффективных аллелей – 3,58. Наибольшая частота встречаемости (0,75) по всей популяции выявлена у локуса SPS115 с аллелью 248, по хозяйствам её распространение составило от 0,72 до 0,83. Для локуса SPS115 редкими аллелями являются 252, 254 и 256. По локусу BM1818 выявлено 6 аллелей. Наибольшую частоту встречаемости во всех исследуемых стадах имеет аллель 266, также в достаточном количестве присутствуют аллели 262, 264 и 270. Наибольшую частоту встречаемости по стадам в локусе BM1824 имеет аллель 182 (от 0,46 до 0,64), в среднем по выборке – 0,51. Выявлены редкие аллели, которые присутствуют только в отдельных стадах с частотой встречаемости от 0,01 до 0,02. Среднее число наблюдаемой гетерозиготности составило 0,71, а ожидаемой на 0,60 % меньше наблюдаемой. В ходе исследования установлено, что наибольший надой имели первотелки в племенном заводе I (6871 кг, p 0,001), в этом стаде выявлены редкие аллели – 179 в локусе CSSM66 и 268 в локусе BM1818. В племенном репродукторе III выявлено наибольшее количество аллелей, которых нет в других стадах. От первотелок этого стада получена наибольшая массовая доля жира – 4,36 % и массовая доля белка – 3,45 %. Индекс фиксации во всех исследуемых стадах являлся отрицательным (-0,019), что свидетельствует об избытке гетерозигот. Полученные данные позволят контролировать уровень гомозиготности в стадах и учитывать аллельный полиморфизм маточного поголовья при закреплении быков-производителей для получения племенного молодняка и в заказных спариваниях.

1. Голштинская порода в создании улучшенных генотипов и внутрипородных типов крупного рогатого скота / Н.М. Косяченко, М.В. Абрамова, А.В. Ильина [и др.]. – Ярославль: ООО «Канцлер», 2020. – 157 с.

2. Происхождение и племенная ценность быков-производителей, от которых получены коровы с рекордной продуктивностью / О.Л. Хромова, Н.И. Абрамова, М.О. Селимян [и др.], // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2024. – № 2. – С. 270–280. – DOI: 10.31677/2072-6724-2024-71-2-270-280.

3. Роженцов А.Л. Влияние кровности и линейной принадлежности на показатели молочной продуктивности коров // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2020. – № 2. – С. 97–105. – DOI: 10.31677/2072-6724-2020-55-2-97-105.

4. Зырянова С.В., Абрамова М.В. Реализация генетического потенциала коров ярославской породы // Аграрный научный журнал. – 2023. – № 11. – С. 144–147. – DOI: 10.28983/asj.y2023i11pp144-147.

5. Genetic Structure Analysis of 155 Transboundary and Local Populations of Cattle (Bos taurus, Bos indicus and Bos grunniens) Based on STR Markers / E. Solodneva, G. Svishcheva, R. Smolnikov [et. al.] // Int J Mol Sci. – 2023. – Vol. 24, № 5. – Р. 5061. – DOI: 10.3390/ijms24055061.

6. Изучение генетической структуры крупного рогатого скота герефордской породы с применением микросателлитных маркеров / Е.Г. Насамбаев, И.С. Бейшова, Т.В. Ульянова [и др.] // Наука и образование. – 2023. – № 2–1(71). – С. 74–82. – DOI: 10.52578/2305-9397-2023-2-1-74-82.

7. Характеристика аллелофонда холмогорской породы крупного рогатого скота с использованием STR-маркеров / В.В. Волкова, О.С. Романенкова, Т.Е. Денискова [и др.] // Молочное и мясное скотоводство. – 2019. – № 7. – С. 3–7.

8. Генетическая структура аборигенного тагильского скота по STR- и SNP-маркерам / Ю.А. Столповский, С.В. Бекетов, Е.В. Солоднева [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – Т. 56, № 6. – С. 1123–1133. – DOI: 10.15389/agrobiology.2021.6.1123rus.

9. Investigation of the Genetic Diversity of Dagestan Mountain Cattle Using STR-Markers / V.V. Volkova, A.S. Abdelmanova, T.E. Deniskova [et al.] // Diversity. – 2022. – № 14(7). – P. 569. – DOI: 10.3390/d14070569.

10. Genetic Diversity and Population Structure of Taurine Cattle Using STR Markers in Burkina Faso, West Africa / A. Tapsoba, S. Sawadogo, B. Yougbaré [et al.] // Tropical Animal Science Journal. – 2024. – № 47. – Р. 131–140. – DOI: 10.5398/tasj.2024.47.2.131.

11. Analysis of the relationship between short tandem repeats and lactation performance of Xinjiang Holstein cows / Y. Li, L. Liu, A. Zunongjiang [et al.] // Trop Anim Health Prod. – 2023. – Vol. 55, № 4. – Р. 238. – DOI: 10.1007/s11250-023-03651-y.

12. Peakall R.O.D., Smouse P.E. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Molecular ecology notes. – 2006. – Vol. 6, №1. – P. 288–295.

13. Часовщикова М.А. Генетическая характеристика голштинской породы крупного рогатого скота с использованием микросателлитных ДНК-маркеров // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. – 2019. – № 2 (76). – С. 191–193.

14. Часовщикова М.А. Генетическая характеристика черно-пестрой породы крупного рогатого скота c использованием микросателлитных маркеров // Вестник Бурятской государственной сельскохозяйственной академии им. В.Р. Филиппова. – 2021. – № 1 (62). – С. 64–69. – DOI: 10.34655/bgsha.2021.62.1.009.

15. Николаев С.В. Полиморфизм ДНК-микросателлит айрширского скота Республики Коми и Кировской области // Аграрный научный журнал. – 2021. – № 9. – С. 67–70. – DOI: 10.28983/asj.y2021i9pp67-70.

16. Каюмов Ф.Г., Третьякова Р.Ф. Микросателлитный анализ ДНК крупного рогатого скота калмыцкой породы, выращенного в Республике Калмыкия // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. – 2023. – № 4 (102). – С. 261–265. – DOI: 10.37670/2073-0853-2023-102-4-261-265.

17. Полиморфизм 15 микросателлитных локусов ДНК у крупного рогатого скота калмыцкой породы и аборигенного якутского скота, разводимых на территории Республики Саха (Якутия) / И.И. Слепцов, В.В. Додохов, Н.И. Павлова [и др.] // Животноводство и кормопроизводство. – 2019. – Т. 102, № 2. – С. 60–67. – DOI: 10.33284/2658-3135-102-2-60.