Генетическое разнообразие популяции аборигенного якутского скота по микросателлитным локусам

Приведены результаты анализа генетической характеристики по 15 микросателлитным локусам современной популяции якутского скота генофондного предприятия ГКП РС(Я) «Якутский скот». Якутский аборигенный скот, считающийся одной из уникальных местных пород в России, представлен малочисленной популяцией. Она отличается исключительно высокой морозоустойчивостью (вплоть до –60 Сº), неприхотливостью к условиям содержания и выносливостью к недостаточному уровню питания. Сравнительную оценку аллелофонда якутского скота провели по субпопуляциям семи хозяйств: «Саккырыр» Эвено-Бытантайского улуса, «Кылыс» Горного улуса, «Таастаах» Намского улуса, «Куллэги» Амгинского улуса, «Онхой» Верхневилюйского улуса, «Акана» Нюрбинского улуса и «Сымах» Мегино-Кангаласского улуса. Всего были проанализированы данные по 898 головам чистопородного якутского скота. По результатам анализа установлено, что во всех 15 микросателлитных локусах якутского скота распространен полиморфизм аллелей – от 3 до 10. Наиболее полиморфным является локус TGLA53, в котором имеется 10 аллелей, несмотря на это число эффективных аллелей в данном локусе всего 2,76. С наибольшей частотой в данном локусе встречается аллель 160 (0,534), с наименьшей – 188 (0,009). В локусах BM1818, INRA023 установлено наименьшее количество аллелей – 3. Из всех проанализированных локусов с наибольшей частотой отмечается аллель 256 локуса SPS115 с частотой встречаемости 0,733. Самые редкие аллели встречались с частотой 0,002 и 0,004. В среднем число аллелей на локус аборигенного якутского скота составило 5,91±0,46, что свидетельствует о достаточно высокой консолидированности популяции местного чистопородного якутского скота и о наименьшем генетическом разнообразии имеющегося поголовья местного скота по сравнению с культурными породами. Всего у популяции якутского скота выявлено 90 аллелей.

1. Романов П.А. Охрана и использование генофонда якутского скота. – Якутск: Бичик, 2020. – 144 с.

2. Паронян И.А. Современное состояние генофонда молочных и молочно-мясных пород крупного рогатого скота в Российской Федерации // Достижения науки и техники АПК. – 2020. – Т. 34, № 6. – С. 79–83.

3. Попов Р.Г., Попова Н.В. Проблемы сохранения и использования генофонда якутского скота // Вестник КрасГАУ. – 2020. – № 6. – С. 150–159.

4. Горохов Н.И. Изучение и использование генофонда якутского скота // Научные исследования по скотоводству в Якутии. – Новосибирск: Наука, 2000. – С. 6–12.

5. The genetic structure of cattle populations (Bos taurus) in northern Eurasia and the neighbouring Near Eastern regions: implications for breeding strategies and conservation / M.H. Li, I. Tapio, J. Vilkki [et al.] // Mol Ecol. – 2007, Sep. – Vol. 16 (18). – P. 3839–3853.

6. Микросателлитный анализ якутского скота / Н.П. Филиппова, Н.И. Павлова, Л.П. Корякина [и др.] // Животноводство и кормопроизводство. – 2018. – Т. 101, № 4. – С. 58–63.

7. Maternal and paternal genealogy of Eurasian taurine cattle (Bos taurus) / J. Kantanen, C.J. Edwards, D.G. Bradley [et al.] // Heredity (Edinb). – 2009, Nov. – Vol. 103 (5). – P. 404–415.

8. Study of genetic diversity and population structure of five Russian cattle breeds using whole-genome SNP analysis / N.A. Zinovieva, A.V. Dotsev, A.A. Sermyagin [et al.] // Sel’skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology]. – 2016. – Vol. 51 (2). – P. 788–800. – DOI: 10.15389/agrobiology.2016.6.788eng.

9. Genetic diversity and genomic signatures of selection among cattle breeds from Siberia, eastern and northern Europe / T. Iso–Touru, M. Tapio, J. Vilkki [et al.] // Anim Genet. – 2016. – Vol. 47 (6). – P. 647–657. – DOI: 10.1111/age.12473.

10. Whole-genome SNP analysis elucidates the genetic structure of Russian cattle and its relationship with Eurasian taurine breeds / A.A. Sermyagin, A.V. Dotsev, E.A. Gladyr [et al.] // Genetics, selection, evolution : GSE. – 2018. – Vol. 50 (1). – P. 37. – https://doi.org/10.1186/s12711–018–0408–8.

11. Whole-Genome Sequencing of Three native cattle breeds originating from the northernmost cattle farming regions / M. Weldenegodguad, R. Popov, K. Pokharel [et al.] // Frontiers in genetics. – 2019. – Vol. 9. – P. 728. – https://doi.org/10.3389/fgene.2018.00728.

12. Yudin N.S., Larkin D.M. Whole genome studies of origin, selection and adaptation of the Russian cattle breeds // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. – 2019. – Vol. 23 (5). – P. 559–568. – DOI: 10.18699/VJ19.525.

13. Шаталина О.С., Ткаченко И.В., Ярышкин А.А. Генетическая структура популяции голштинизированного черно-пестрого скота по микросателлитным локусам // Генетика. – 2021. – Т. 57, № 2. – С. 205–213.

14. Шукюрова Е.Б., Лукашина А.А., Бузько А.Н. Генетическая характеристика голштинского крупного рогатого скота по ДНК-микросателлитам // Вестник ДВО РАН. – 2020. – № 4. – С. 47–52.

15. Характеристика аллелофонда якутского скота по микросателлитам / Е.А. Гладырь, Я.Л. Шадрина, П.В. Горелов [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2011. – № 6. – С. 65–69.