vestngauВестник университета биотехнологийVestnik University of biotechnologiy3033-8433Publishing Centre “Zolotoy Kolos” of Novosibirsk State Agrarian University10.31677/2072-6724-2024-73-4-198-206vestngau-2443Research ArticleВЕТЕРИНАРИЯ, ЗООТЕХНИЯ И БИОТЕХНОЛОГИЯVETERINARY, ANIMAL SCIENCES AND BIOTECHNOLOGYПолиморфизм микросателлитных локусов ярославского скота в стадах различного селекционного значенияPolymorphism of microsatellite loci of yaroslavl cattle in herds of various breeding valuesИльинаА. В.IlyinaA. V.

Кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник

Ярославль

PhD in Agricultural Sciences, Leading Researcher

Yaroslavl

АбрамоваМ. В.AbramovaM. V.

Кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник

Ярославль

PhD in Agricultural Sciences, Leading Researcher

Yaroslavl

abramovam2016@yandex.ruЗыряноваС. В.ZyryanovaS. V.

Старший научный сотрудник

Ярославль

Senior Researcher

Yaroslavl

ЕвдокимовЕ. Г.EvdokimovE. G.

Старший научный сотрудник

Ярославль

Senior Researcher

Yaroslavl

МуштуковаЮ. В.MushtukovaYu. V.

Старший научный сотрудник

Ярославль

Senior Researcher

Yaroslavl

ПриданниковаН. В.PridannikovaN. V.

Научный сотрудник

Ярославль

Research Associate

Yaroslavl

КоноваловА. В.KonovalovA. V.

Доктор сельскохозяйственных наук, доцент, директор

Ярославль

Doctor of Agricultural Sciences, Associate Professor, Director

Yaroslavl

Ярославский научно-исследовательский институт животноводства и кормопроизводства — филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный научный центр кормопроизводства и агроэкологии им. В.Р. Вильямса»РоссияFederal Williams Research Center for Forage Production and Agroecology, Scientific Research Institute of Livestock Breeding and Forage ProductionRussian Federation20242501202504198206Copyright © Ильина А.В., Абрамова М.В., Зырянова С.В., Евдокимов Е.Г., Муштукова Ю.В., Приданникова Н.В., Коновалов А.В., 20252025Ильина А.В., Абрамова М.В., Зырянова С.В., Евдокимов Е.Г., Муштукова Ю.В., Приданникова Н.В., Коновалов А.В.Ilyina A.V., Abramova M.V., Zyryanova S.V., Evdokimov E.G., Mushtukova Y.V., Pridannikova N.V., Konovalov A.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://vestngau.elpub.ru/jour/article/view/2443

В работе представлены результаты изучения полиморфизма микросателлитных локусов крупного рогатого скота ярославской породы в племенных стадах Ярославской области. По 15 микросателлитным локусам ДНК было выявлено 115 аллелей с различной частотой встречаемости. В каждом из изучаемых локусов идентифицировано от 5 до 11 аллелей. Среднее число аллелей на локус составило 6,41, количество эффективных аллелей – 3,58. Наибольшая частота встречаемости (0,75) по всей популяции выявлена у локуса SPS115 с аллелью 248, по хозяйствам её распространение составило от 0,72 до 0,83. Для локуса SPS115 редкими аллелями являются 252, 254 и 256. По локусу BM1818 выявлено 6 аллелей. Наибольшую частоту встречаемости во всех исследуемых стадах имеет аллель 266, также в достаточном количестве присутствуют аллели 262, 264 и 270. Наибольшую частоту встречаемости по стадам в локусе BM1824 имеет аллель 182 (от 0,46 до 0,64), в среднем по выборке – 0,51. Выявлены редкие аллели, которые присутствуют только в отдельных стадах с частотой встречаемости от 0,01 до 0,02. Среднее число наблюдаемой гетерозиготности составило 0,71, а ожидаемой на 0,60 % меньше наблюдаемой. В ходе исследования установлено, что наибольший надой имели первотелки в племенном заводе I (6871 кг, p 0,001), в этом стаде выявлены редкие аллели – 179 в локусе CSSM66 и 268 в локусе BM1818. В племенном репродукторе III выявлено наибольшее количество аллелей, которых нет в других стадах. От первотелок этого стада получена наибольшая массовая доля жира – 4,36 % и массовая доля белка – 3,45 %. Индекс фиксации во всех исследуемых стадах являлся отрицательным (-0,019), что свидетельствует об избытке гетерозигот. Полученные данные позволят контролировать уровень гомозиготности в стадах и учитывать аллельный полиморфизм маточного поголовья при закреплении быков-производителей для получения племенного молодняка и в заказных спариваниях.

The paper presents the results of studying the polymorphism of microsattellite loci of Yaroslavl cattle in breeding herds of the Yaroslavl region. 115 alleles with different frequency of occurrence were identified for 15 microsatellite DNA loci. From 5 to 11 alleles were identified in each of the studied loci. The average number of alleles per locus was 6.41, the number of effective alleles was 3.58. The highest incidence (0.75) in the entire population was found in locus SPS115 with allele 248, its distribution ranged from 0.72 to 0.83 across farms. For the SPS115 locus, the rare alleles are 252, 254 and 256. 6 alleles were identified at the BM1818 locus. Allele 266 has the highest frequency of occurrence in all the studied herds, and alleles 262, 264 and 270 are present in sufficient numbers. The allele 182 has the highest frequency of occurrence in herds at the BM1824 locus (from 0.46 to 0.64), with an average of 0.51 in the sample. Rare alleles have been identified, which are present only in individual herds with a frequency of occurrence from 0.01 to 0.02. The average number of observed heterozygosity was 0.71, and the expected one was 0.60% less than the observed one. The study found that the first hard the heifers had the highest yield (6871 kg, p < 0.001), rare alleles were identified in this herd – 179 at the CSSM66 locus and 268 at the BM1818 locus. The largest number of alleles, which are not present in other herds, was revealed in the breeding herd III. The higher fat content was obtained from the first heifers of this herd – 4.36% and the higher protein content – 3.45%.The fixation index in all the studied herds was negative (-0.019), which indicates an excess of heterozygotes. The obtained data will allow controlling the level of homozygosity in herds, and taking into account the allelic polymorphism of the breeding stock when fixing bulls of producers to obtain breeding offspring and in custom mating.

 

крупный рогатый скотярославская породаполиморфизммикросателлитные локусыаллелигетерозиготностьмолочная продуктивностьdairy cattleyaroslavl breedpolymorphismmicrosatellite lociallelesheterozygositydairy productivityReferencesГолштинская порода в создании улучшенных генотипов и внутрипородных типов крупного рогатого скота / Н.М. Косяченко, М.В. Абрамова, А.В. Ильина [и др.]. – Ярославль: ООО «Канцлер», 2020. – 157 с.Kosyachenko N.M., Abramova M.V., Il`ina A.V., Zy`ryanova S.V., Konovalov A.V, Kosourova T.N., Golshtinskaya poroda v sozdanii uluchshenny`x genotipov i vnutriporodny`x tipov krupnogo rogatogo skota (The Holstein breed in the creation of improved genotypes and intrabreed types of cattle), Yaroslavl`: OOO «Kanczler», 2020, 157 р.Происхождение и племенная ценность быков-производителей, от которых получены коровы с рекордной продуктивностью / О.Л. Хромова, Н.И. Абрамова, М.О. Селимян [и др.], // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2024. – № 2. – С. 270–280. – DOI: 10.31677/2072-6724-2024-71-2-270-280.Xromova O.L., Abramova N.I., Selimyan M.O., Zenkova N.V., Vestnik NGAU (Novosibirskij gosudarstvenny`j agrarny`j universitet), 2024, No. 2, pp. 270–280, DOI: 10.31677/2072-6724-2024-71-2-270-280. (In Russ.)Роженцов А.Л. Влияние кровности и линейной принадлежности на показатели молочной продуктивности коров // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). – 2020. – № 2. – С. 97–105. – DOI: 10.31677/2072-6724-2020-55-2-97-105.Rozhenczov A.L., Vestnik NGAU (Novosibirskij gosudarstvenny`j agrarny`j universitet), 2020, No. 2, pp. 97–105, DOI: 10.31677/2072-6724-2020-55-2-97-105. (In Russ.)Зырянова С.В., Абрамова М.В. Реализация генетического потенциала коров ярославской породы // Аграрный научный журнал. – 2023. – № 11. – С. 144–147. – DOI: 10.28983/asj.y2023i11pp144-147.Zyryanova S.V., Abramova M.V., Agrarny`j nauchny`j zhurnal, 2023, No. 11, pp. 144–147, DOI: 10.28983/asj.y2023i11pp144-147. (In Russ.)Genetic Structure Analysis of 155 Transboundary and Local Populations of Cattle (Bos taurus, Bos indicus and Bos grunniens) Based on STR Markers / E. Solodneva, G. Svishcheva, R. Smolnikov [et. al.] // Int J Mol Sci. – 2023. – Vol. 24, № 5. – Р. 5061. – DOI: 10.3390/ijms24055061.Solodneva E., Svishcheva G., Smolnikov R. [et al.], Genetic Structure Analysis of 155 Transboundary and Local Populations of Cattle (Bos taurus, Bos indicus and Bos grunniens) Based on STR Markers, Int J Mol Sci, 2023, Vol. 24, No. 5, pp. 5061, Doi: 10.3390/ijms24055061.Изучение генетической структуры крупного рогатого скота герефордской породы с применением микросателлитных маркеров / Е.Г. Насамбаев, И.С. Бейшова, Т.В. Ульянова [и др.] // Наука и образование. – 2023. – № 2–1(71). – С. 74–82. – DOI: 10.52578/2305-9397-2023-2-1-74-82.Nasambaev E.G., Bejshova I.S., Ul`yanova T.V., Chernyaeva S.A., Nauka i obrazovanie, 2023, No. 2–1 (71), pp. 74– 82, DOI: 10.52578/2305-9397-2023-2-1-74-82. (In Russ.)Характеристика аллелофонда холмогорской породы крупного рогатого скота с использованием STR-маркеров / В.В. Волкова, О.С. Романенкова, Т.Е. Денискова [и др.] // Молочное и мясное скотоводство. – 2019. – № 7. – С. 3–7.Volkova V.V., Romanenkova O.S., Deniskova T.E. [i dr.], Molochnoe i myasnoe skotovodstvo, 2019, No. 7, pp. 3-7. (In Russ.)Генетическая структура аборигенного тагильского скота по STR- и SNP-маркерам / Ю.А. Столповский, С.В. Бекетов, Е.В. Солоднева [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2021. – Т. 56, № 6. – С. 1123–1133. – DOI: 10.15389/agrobiology.2021.6.1123rus.Stolpovskij Yu.A., Beketov S.V., Solodneva E.V. [i dr.], Sel`skoxozyajstvennaya biologiya, 2021, Vol. 56, No. 6, pp. 1123–1133, DOI: 10.15389/agrobiology.2021.6.1123rus. (In Russ.)Investigation of the Genetic Diversity of Dagestan Mountain Cattle Using STR-Markers / V.V. Volkova, A.S. Abdelmanova, T.E. Deniskova [et al.] // Diversity. – 2022. – № 14(7). – P. 569. – DOI: 10.3390/d14070569.Volkova V.V., Abdelmanova A.S., Deniskova T.E. [et al.], Investigation of the Genetic Diversity of Dagestan Mountain Cattle Using STR-Markers, Diversity, 2022, Vol. 14, No. 7, pp. 569, DOI: 10.3390/d14070569.Genetic Diversity and Population Structure of Taurine Cattle Using STR Markers in Burkina Faso, West Africa / A. Tapsoba, S. Sawadogo, B. Yougbaré [et al.] // Tropical Animal Science Journal. – 2024. – № 47. – Р. 131–140. – DOI: 10.5398/tasj.2024.47.2.131.Tapsoba A., Sawadogo S., Yougbaré B. [et al.], Genetic Diversity and Population Structure of Taurine Cattle Using STR Markers in Burkina Faso, West Africa, Tropical Animal Science Journal, 2024, No. 47, pp. 131–140. 10.5398/tasj.2024.47.2.131.6.Analysis of the relationship between short tandem repeats and lactation performance of Xinjiang Holstein cows / Y. Li, L. Liu, A. Zunongjiang [et al.] // Trop Anim Health Prod. – 2023. – Vol. 55, № 4. – Р. 238. – DOI: 10.1007/s11250-023-03651-y.Li Y., Liu L., Zunongjiang A. [et al.], Analysis of the relationship between short tandem repeats and lactation performance of Xinjiang Holstein cows, Trop Anim Health Prod, 2023, Vol. 55, No. 4, pp. 238, DOI: 10.1007/s11250-023-03651-y.Peakall R.O.D., Smouse P.E. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Molecular ecology notes. – 2006. – Vol. 6, №1. – P. 288–295.Peakall R.O.D., Smouse P.E., GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research, Molecular ecology notes, 2006, Vol. 6, No. 1, pp. 288–295.Часовщикова М.А. Генетическая характеристика голштинской породы крупного рогатого скота с использованием микросателлитных ДНК-маркеров // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. – 2019. – № 2 (76). – С. 191–193.Chasovshhikova M.A., Izvestiya Orenburgskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta, 2019, No. 2 (76), pp. 191–193. (In Russ.)Часовщикова М.А. Генетическая характеристика черно-пестрой породы крупного рогатого скота c использованием микросателлитных маркеров // Вестник Бурятской государственной сельскохозяйственной академии им. В.Р. Филиппова. – 2021. – № 1 (62). – С. 64–69. – DOI: 10.34655/bgsha.2021.62.1.009.Chasovshhikova M.A., Vestnik Buryatskoj gosudarstvennoj sel`skoxozyajstvennoj akademii im. V.R. Filippova, 2021, No. 1 (62), pp. 64–69, DOI: 10.34655/bgsha.2021.62.1.009. (In Russ.)Николаев С.В. Полиморфизм ДНК-микросателлит айрширского скота Республики Коми и Кировской области // Аграрный научный журнал. – 2021. – № 9. – С. 67–70. – DOI: 10.28983/asj.y2021i9pp67-70.Nikolaev S.V., Agrarny`j nauchny`j zhurnal, 2021, No. 9, pp. 67–70, DOI: 10.28983/asj.y2021i9pp67-70. (In Russ.)Каюмов Ф.Г., Третьякова Р.Ф. Микросателлитный анализ ДНК крупного рогатого скота калмыцкой породы, выращенного в Республике Калмыкия // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. – 2023. – № 4 (102). – С. 261–265. – DOI: 10.37670/2073-0853-2023-102-4-261-265.Kayumov F.G., Tret`yakova R.F., Izvestiya Orenburgskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta, 2023, No. 4 (102), pp. 261–265, DOI: 10.37670/2073-0853-2023-102-4-261-265. (In Russ.)Полиморфизм 15 микросателлитных локусов ДНК у крупного рогатого скота калмыцкой породы и аборигенного якутского скота, разводимых на территории Республики Саха (Якутия) / И.И. Слепцов, В.В. Додохов, Н.И. Павлова [и др.] // Животноводство и кормопроизводство. – 2019. – Т. 102, № 2. – С. 60–67. – DOI: 10.33284/2658-3135-102-2-60.Slepczov I.I., Dodoxov V.V., Pavlova N.I., Kayumov F.G., Zhivotnovodstvo i kormoproizvodstvo, 2019, Vol. 102, No. 2, pp. 60–67, DOI: 10.33284/2658-3135-102-2-60. (In Russ.)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.